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20 lines
1013 B
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# Sample dna matrix from FASTA package
A C G T X R Y M W S K D H V B N -
A 5 -4 -4 -4 -4 2 -1 2 2 -1 -1 1 1 1 -2 -1 -1
C -4 5 -4 -4 -4 -1 2 2 -1 2 -1 -2 1 1 1 -1 -1
G -4 -4 5 -4 -4 2 -1 -1 -1 2 2 1 -2 1 1 -1 -1
T -4 -4 -4 5 5 -1 2 -1 2 -1 2 1 1 -2 1 -1 -1
X -4 -4 -4 5 5 -1 2 -1 2 -1 2 1 1 -2 1 -1 -1
R 2 -1 2 -1 -1 2 -2 -1 1 1 1 1 -1 1 -1 -1 -1
Y -1 2 -1 2 2 -2 2 -1 1 1 1 -1 1 -1 1 -1 -1
M 2 2 -1 -1 -1 -1 -1 2 1 1 -1 -1 1 1 -1 -1 -1
W 2 -1 -1 2 2 1 1 1 2 -1 1 1 1 -1 -1 -1 -1
S -1 2 2 -1 -1 1 1 1 -1 2 1 -1 -1 1 1 -1 -1
K -1 -1 2 2 2 1 1 -1 1 1 2 1 -1 -1 1 -1 -1
D 1 -2 1 1 1 1 -1 -1 1 -1 1 1 -1 -1 -1 -1 -1
H 1 1 -2 1 1 -1 1 1 1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1 -1
V 1 1 1 -2 -2 1 -1 1 -1 1 -1 -1 -1 1 -1 -1 -1
B -2 1 1 1 1 -1 1 -1 -1 1 1 -1 -1 -1 1 -1 -1
N -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
- -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1